| 1 | Автовокзал — Железнодорожный вокзал | | Рыбинское ПАТП-2 (Таксопарк) (Закрыто) | Рыбинск, маршрутные такси | | | |
| 2А | Улица Танкистов — Площадь Маяковского | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 4т | Троллейбусный парк — Завод "Призма" | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | | 01.2016 | |
| 5т | Железнодорожный вокзал — Посёлок ГЭС-14 | | | Рыбинск, маршрутные такси | | | |
| 7 | Железнодорожный вокзал — Автовокзал | | МУП "ПАТП №1 г.Рыбинска" | | | ≈ 2010 | |
| 7 | Железнодорожный вокзал — Гладкое | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 7т | Посёлок Юбилейный — Посёлок Кирова | | ИП Евсин И.П. (Закрыто) | Рыбинск, маршрутные такси | | 11.2013 | |
| 8/20 | Соборная площадь — Улица Каляева | | ОАО "ПАТП № 1" | | 01.09.2020 | 30.04.2024 | |
| 10 | ЗАО "Свобода" — Призма | | ОАО "ПАТП № 1" | | 01.07.2019 | 30.04.2024 | |
| 12а | Железнодорожный вокзал — Улица Корнева | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 12т | ПАТП № 1 — Автовокзал | | | Рыбинск, маршрутные такси | | 09.11.2010 | |
| 14к | Больница № 4 — Больница № 3 | | ИП Тамаев В.А. | | 10.06.2024 | 04.08.2025 | |
| 17т | Автовокзал — Больница № 3 | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 23.01.2012 | 06.01.2015 | |
| 18т | Троллейбусный парк — Улица Пестеля | | ИП Матавкин В.В. | Рыбинск, маршрутные такси | | 06.12.2020 | |
| 19/11 | Соборная площадь — Улица Тарасова | | ОАО "ПАТП № 1" | | 01.09.2020 | 30.04.2024 | |
| 21т | Железнодорожный вокзал — Посёлок Ермаково | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | | | |
| 22т | Улица Расторгуева — Автовокзал | | ИП Пылаев П.В. (Закрыто) | Рыбинск, маршрутные такси | | | |
| 23т | Завод "Свобода" — Завод "Призма" | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | | 31.07.2019 | |
| 26т | Посёлок Юбилейный — Завод "Призма" | | ИП Антонов М.Н. | Рыбинск, маршрутные такси | | 2015 | |
| 27 | Железнодорожный вокзал — ПАТП № 1 | | ОАО "ПАТП № 1" | | 09.01.2015 | ≈ 2018 | |
| 30т | Железнодорожный вокзал — Улица Расторгуева | | ИП Тамаев В.А. | Рыбинск, маршрутные такси | 10.02.2018 | 31.08.2018 | |
| 33т | МФЦ — Больница № 4 | | ИП Матавкин В.В. | Рыбинск, маршрутные такси | | 06.12.2020 | |
| 50э | Соборная площадь — Южное кладбище | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 52э | Ж.д. вокзал — Южное кладбище | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 102 | Железнодорожный вокзал — Балобаново — Судоверфь | | МУП "ПАТП №1 г.Рыбинска" | | | ≈ 2010 | |
| 104 | Рыбинск — Михайловское | | ООО "СтарТранс" (Рыбинск) | | 01.01.2020 | 04.2023 | |
| 104к | Рыбинск — Михайловское | | ООО "ПАТП-8" (Рыбинск) (Закрыто) | | | 31.03.2026 | |
| 106 | Улица Ворошилова — Михайловское | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 109 | Рыбинск (ж/д вокзал) — Майский — Гаврилово | | Рыбинский филиал АО "Ярославское АТП" | | | 31.03.2026 | |
| 110 | Автовокзал — Волково | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 111 | Рыбинск (ж/д вокзал) — Свингино — Судоверфь | | ООО "ПАТП-8" (Рыбинск) (Закрыто) | | | 31.03.2026 | |
| 111т | Железнодорожный вокзал — Судоверфь | | ИП Тамаев В.А.
ИП Пилясов О.Ю. (Рыбинск) (Закрыто) | Рыбинск, маршрутные такси | | 31.05.2013 | |
| 112т | Железнодорожный вокзал — Дёмино | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 2004 | | |
| 113т | Железнодорожный вокзал — Волково | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 2005 | | |
| 127т | Железнодорожный вокзал — Глебово | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 2005 | | |
| 130 | Рыбинск — Дюдьково | | ООО "АВТОМИГ" (Рыбинск) | | 01.01.2020 | 31.12.2020 | |
| 130 | Тутаев — Рыбинск | Тутаевский район | ООО "Трансэкспедиция" / АО АТП "Ярославич" (правый берег) | | 11.1997 | 31.12.2019 | |
| 130а | Тутаев — Рыбинск (через Дюдьково) | Тутаевский район | ООО "Трансэкспедиция" / АО АТП "Ярославич" (правый берег) | | 11.2004 | 31.12.2019 | |
| 155 | Рыбинск — Дёмино | | ОАО "ПАТП № 1" | | | | |
| 163 | Рыбинск — Волково | | ГП ЯО "Рыбинское ГПАТП №3" (Закрыто) | | | | |
| 170 | ДК "Вымпел" — Дурдино | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 171 | Железнодорожный вокзал — Дурдино | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 172 | Железнодорожный вокзал — Исанино | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 173 | Железнодорожный вокзал — Староселье | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 174 | Железнодорожный вокзал — Красная горка | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 176 | Соборная площадь — Тимново | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 177 | Магазин "Юбилейный" — Тимново | | ОАО "ПАТП № 1" | Рыбинск, маршрутные такси | 1994 | | |
| 205 | Ярославль — Рыбинск | Ярославль и Ярославский район | ГП ЯО "Рыбинское ГПАТП №3" (Закрыто)
ОАО "Ярославское ПАТП-3" (Ярославль) (Закрыто) | | | ≈ 2007 | |
| 258 | Рыбинск — Пошехонье | Пошехонский район | ГП ЯО "Рыбинское ГПАТП №3" (Закрыто)
ГП ЯО "Пошехонское АТП" (Закрыто)
ЗАО "АТП "Автомобилист" (Закрыто) | | | ≈ 2007 | |
| 910 | Рыбинск — Иваново | | ООО Рыбинское ПАТП №1 (Закрыто) | Межрегиональные маршруты | | | |
| | Ж.д. вокзал — Южное кладбище — Соборная площадь | | ОАО "ПАТП № 1" | | 23.06.2024 | 23.06.2024 | бесплатный экспресс |
| | Соборная площадь — Улица Максима Горького | | ОАО "ПАТП № 1" | | 16.05.2026 | 18.05.2026 | бесплатный |
| | Соборная площадь — ЦЛС "Дёмино" | | ГП ЯО "Рыбинское ГПАТП №3" (Закрыто) | | 23.01.2010 | 05.02.2012 | |
